Glossary

Principe des transferts horizontaux et verticaux de gènes :

On considère que l'évolution est un phénomène en arborescence, on fait donc l'analogie avec la structure d'un arbre pour expliquer son fonctionnement. Vu de l'extérieur, d'un tronc proviennent de nombreuses branches qui s'en séparent de manière dichotomique (division en 2 à la base de chaque branche) ou polytomique (division en plus de 2). Ainsi, chaque branche est unique car elle se développe dans un espace qui lui est propre, en effet une autre branche ne peut pas pousser à l'endroit où elle se trouve puisqu'elle occupe déjà cet espace. Pourtant elle est liée à toutes les autres branches et se développe en même temps que les autres. On peut faire l'analogie entre une branche et une stabilité génétique qui persiste dans le temps et l'espace (une espèce par exemple)

Légende :

r.t. : Arbre réel

t.t. : Arbre théorique (réalisé à partir de l'observation des espèces actuelles)

h.t. : Transfert horizontal (transfert de gène entre 2 lignées)

v.t. : Transfert vertical (transfert de gène dans une même lignée d'une génération à l'autre)

Explication du schéma :

D'une espèce A s'en forme 2 : A1 et A2. Celles-ci acquièrent indépendamment des caractères différents, des trous ou des piques.
De l'espèce A2 évoluent A2A qui devient rouge et A2B qui reste brune à l'aide de transferts verticaux de gènes qui se transmettent d'une génération à une autre dans une même lignée.
L'espèce A2A donne à l'aide de transferts horizontaux de gènes les caractères qu'elle a acquise au cours de son évolution à l'espèce A1.
Ainsi on obtient 3 espèces qui partagent des caractères communs mais qui les ont acquis de manières très différentes. Sans l'explication du processus réel, il est possible d'imaginer de nombreuses théories, par exemple, on pourrait dire que A1xA2A descend d'un ancêtre commun avec A2A, on ignorerait par cette théorie l'existence de A1.

Problématique liée à ce processus :

Pour expliquer l'origine du vivant, on pourrait croire que les eucaryotes et les archées ont dérivés des bactéries et s'en sont séparés à jamais. Pourtant, on sait que les bactéries et les archées sont capables de transferts horizontaux de gènes et on peut imaginer la même chose pour les eucaryotes primitifs. Il est donc possible d'expliquer l'origine de ces 3 domaines qui se sont différenciés à partir d'organismes qu'on appelera "progénotes". Ceux-ci sont les ancêtres de toute forme de vie et se mélangeraient leur génome entre eux expliquant alors que les bactéries, les archées et les eucaryotes aient des caractères en commun entre 2 groupes mais différent de celui restant. En bref, voici quelques exemples de caractères : les bactéries et les archées possèdent un chromosome unique et circulaire alors que les eucaryotes ont de multiples chromosomes linéaires ; les bactéries et les eucaryotes ont une bicouche lipidique avec des acides gras estérifiant le glycérol alors que les archées ont une mono- ou une bicouche avec des alcools gras en di- ou tétra-ethers de glycérol ; les eucaryotes et les archées initient leur traduction via la méthionine tandis que les bactéries le font à l'aide de formyl-méthionine.

Légende :

Habitus : hb. herbacée, abs. arbuste, ar. arbre

Racines : mar. méristème apical racinaire, r2. racine secondaire, rdc. radicelles, ad. adventives, pv. pivot, drg. drageonnantes, ae. aériennes

Tiges : mac. méristème apical caulinaire, ba. bourgeon axillaire, ch. chaume, vlb. volubiles, rhy. rhyzome, sti. stipe, st. stolon, suc. succulente, tb. tubercule

Phyllotaxie : vt. verticillée, alt. alternée, op. opposée

Nervation : pn. pennée, plm. palmée, prl. parallèle

Marge : dcp. découpée, dt. dentée, lb. lobée, et. entière

Composée/simples : s. simple, sco. simple composée, pco. palmée composée

upn. unipennée, bpn. bipennée, tpn. tripennée

Légende :

Pièces florales : pd. pédoncule, rcp. réceptacle, sp. sépale, pt. pétale, c. carpelle, e. étamine

Fleur : dp. dialypétale, ds. dialysépale, gp. gamopétale, gs. gamosépale, act. actinomorphe, zg. zygomorphe

Carpelle : c.su. carpelle supère, c.in. carpelle infère, c.s.in. carpelle semi-infère, c.l. carpelles libres, c.s. carpelles soudés

Etamine : e.l. étamines libres, e.s. étamines soudés

Légende :

Pièces florales : pd. pédoncule, rcp. réceptacle, sp. sépale, pt. pétale, c. carpelle, c.c. chambre carpellaire, ovu. ovule

f. Fruit : pd. pédoncule, rcp. réceptacle, sp. sépale, pt. pétale, gr. graine

Inflorescence : c.su. carpelle supère, c.in. carpelle infère, c.l. carpelles libres, ep. épi, brcl. bractéole

Infrutescence : gs. gousse, dr. drupe, f.cx. fruit complexe, pps. pappus, f.cp. fruit composé, f.cp.ag. fruit composé agrégé

Exemple de fruit : ha. haricot, ce. cerise, po. pomme, fb. framboise, ps. pissenlit, bl. blé

Légende :

dr. Drupe : rcp. réceptacle, f. fruit, epc. épicarpe, mc.c. mésocarpe charnu, edc.s. endocarpe sclérifié, gr. graine

b. Baie : rcp. réceptacle, f. fruit, gr. graine, t.s. tégument sclérifié

ak. Akène : f.i. fruit indéhiscent, gr. graine

cp. Capsule : sp. sépale, f.d. fruit déhiscent, gr. graine

f.cx. Fruit complexe : rcp.h. réceptacle hypertrophié, f. fruit, gr. graine